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PATIENT AREA
患者專區(qū)
  • mNGS能夠給臨床患者解決什么問題

    面對重癥感染患者,能否快速確認感染性疾病原體,成為后續(xù)對癥治療的關鍵。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法分為培養(yǎng)和非培養(yǎng)兩類,臨床公認的“金標準”是分離培養(yǎng)和生化鑒定,這種方法的操作周期長、失敗率高,并且不是每種病原體都可以培養(yǎng)。不依賴培養(yǎng)的方法比如涂片鏡檢、抗體抗原免疫等,在采樣當天即可報告結果。這些方法的時效性強,但在敏感性和特異性上存在較明顯的劣勢,而且傳統(tǒng)的微生物鑒定方法對于未知或者罕見的病原微生物,無法快速識別。

    mNGS不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng),也無需特異性擴增,直接對臨床樣本中的核酸進行無差別、無選擇性的高通量測序,然后與已知的微生物序列數(shù)據(jù)庫進行比對分析,根據(jù)比對到的序列信息來判斷樣本包含的病原微生物種類,能夠快速、客觀地檢測臨床樣本中的病原微生物(包括病毒、細菌、真菌、寄生蟲)

    目前已經(jīng)有數(shù)十篇mNGS專家共識中提到,對于一些危重癥感染患者,建議留取合適的標本,進行mNGS檢測,更快更精準的幫助臨床找到感染性疾病原體,從而精準使用抗生素。

  • 做了mNGS檢測結果應該怎么看

    拿到一份mNGS報告應該關注以下專業(yè)名詞:

    l讀長:測序儀單個測序反應所得到的堿基序列。讀長長度指該堿基序列的堿基數(shù)。讀長數(shù)量指測序獲得的堿基序列的數(shù)量。

    l相對豐度:指除去宿主序列之后,某微生物物種序列在相應大類物種(通常分成細菌、真菌、病毒、寄生蟲4大類)中的分布比例。豐度越高,表示該物種所占比例越高。

    l檢出限(limit of detection,LOD):指檢測對象可以被某特定方法可靠地檢測到的最低濃度(嚴格意義上是達到某概率的最低檢測濃度)。

    l比對:指將測序的讀長與參考基因組進行匹配的過程。

    l檢出序列數(shù)(reads):配到該病原體的序列數(shù)目,其多少與標本中病原體本身載量負荷、核酸提取量、人源序列比例有關。序列數(shù)越高,表示標本中檢測到該病原體的可信度越高。

    llmNGS報告具體如何解讀建議進一步詢問臨床醫(yī)生。

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